질환을 진단하거나 원인을 알아내야 하는 경우를 비롯해 유전자 검사는 이제 다방면으로 활용되고 있습니다. 검사를 하면 그에 따른 결과지가 제공되는데요. 특히 희귀질환 진단을 위한 쓰리빌리언의 엑솜(WES)과 지놈(WGS) 검사는 의사의 진단을 돕기 때문에 이 결과 보고서가 복잡하고 해석하기 어렵게 느껴질 수 있습니다. 하지만 여기, 몇 가지를 알면 유전자 검사 결과지를 이해하실 수 있을 거에요.

병원에서 사용하는 엑솜과 지놈 검사는 ACMG(미국임상유전학회) 표준 및 지침에 따라 작성되기 때문에 어떤 실험실에서 검사를 수행하더라도 유사한 구성을 가지고 있습니다.

오늘은 쓰리빌리언의 희귀질환 유전자 검사에 대한 예시 결과지를 살펴보며 설명해볼게요.

병원에서 사용하는 유전자 검사 결과지의 구성

엑솜 검사의 결과지는 일반적으로 검사 결과 부분과 추가 정보 부분, 두 가지로 나누어 볼 수 있습니다.

• 검사 결과 : 주문 정보, 검사 결과 및 결과 해석
• 추가 정보 : 2차 결과, 대상 지역 정보, 검사 방법 및 제한사항

검사 결과

검사 결과 부분에 표시되는 중요한 결과는 다음과 같이 나누어 볼 수 있습니다.

주문 정보 (Order information)

이 영역에는 주문한 의사 정보, 기관 정보, 환자 정보가 포함됩니다. 환자 정보에는 검사의 유형, 검체의 유형, 채취 날짜가 있습니다. 검사 유형은 환자의 검체를 단독으로 검사했는지 아니면 부모 중 한 명 또는 두 명의 검체와 함께 검사했는지를 보여줍니다.

검사 결과 (Test result)

유전자 검사 결과지에서 가장 중요한 부분입니다.

양성 (Positive)

"Positive"라고 나온 경우 환자의 질환에 대한 원인이 발견되었음을 의미합니다. 질환을 유발할 가능성이 90% 이상인 하나 이상의 유전자 변이가 보고된 경우 양성으로 표기하고 있습니다.

미결정 (Inconclusive)

"Inconclusive"는 말 그대로 결정되지 않은 결과를 보여줍니다. 질환의 원인으로 추측되는 가능성이 있는 변이가 확인되었지만 정확하게 진단을 내리기에는 현재 근거가 충분하지 않은 상태입니다. 의심스러운 변이는 변이 분류 정보 및 변이 재분류에 필요한 추가 정보와 함께 보고되고 있습니다.

음성 (Negative)

"Negative"는 환자의 증상을 유발하는 변이가 확인되지 않았음을 나타냅니다.

결과 해석 세부사항 (Result interpretation details)

결과 해석의 근거를 더 자세히 확인할 수 있는 부분입니다.

양성 (Positive)

양성 결과가 나온 경우 이 부분에서는 특정 변이를 진단의 원인 변이로 식별하는데 사용된 증거를 볼 수 있습니다. 검사실에 따라 양식은 간단한 글자부터 표까지 다양할 수 있지만, 주로 해당 변이가 원인 변이로 확인된 이유를 뒷받침하는 증거를 자세히 설명합니다.

또한 진단된 질환에 대한 자세한 정보도 제공됩니다. 일반적으로 질환과 관련된 유전자 및 변이, 질환의 유전 패턴, 질환이 나타내는 증상에 대한 정보가 포함됩니다.

미결정 (Inconclusive)

이 결과가 나온 경우, 변이를 VUS(불확실성 변이형)으로 분류하는 증거에 대한 자세한 정보를 제공합니다.

음성 (Negative)

음성 결과의 경우, 원인 변이가 엑솜 검사에 의해 확인되지 않았다는 것을 한 번 더 설명합니다. 진단을 내릴 수 없었기 때문에 원인 변이가 발견되지 않은 이유를 제공하는 경우가 많습니다. 가장 일반적인 이유는 현재 시퀀싱(sequencing)과 분석 기술의 기술적 한계와 현재까지 알려진 유전자형-표현형 연관성 정보의 한계입니다.

음성 결과는 의사와 환자 모두에게 일차적으로 실망을 줄 수 있습니다. 하지만 새로운 희귀질환 정보가 지속적으로 발견되고 있고, 현재의 한계를 극복하기 위한 기술이 지속적으로 개발되고 있다는 사실을 의사와 환자에게 공유한다면 추후 해답을 찾을 수 있는 가능성은 언제나 열려 있습니다. 

추가 정보 (Additional information)

결과지의 첫 부분에는 주요한 검사 결과가 제공되며 그 밑에는 보충할 수 있는 내용인 추가 정보가 포함되어 있습니다.

2차 소견 (Secondary findings)

ACMG에서 권장하는 73개 유전자에 대한 분석 결과 중 엑솜 검사와 지놈 검사 환자가 받을 수 있는 유전자 검사 결과입니다. 이는 일반적으로 환자의 선택에 따라 포함됩니다.

목표 지역 정보 (Target region information)

이 부분에서는 검사의 시퀀싱 품질에 대해 나와 있습니다 일반적으로 목표 영역 커버리지(coverage)는 평균 깊이와 시퀀싱 깊이로 표에 표시됩니다. 깊이는 각 DNA 영역을 시퀀싱하고 반복적으로 읽은 횟수를 의미하며 50배, 100배로 표시됩니다. 커버리지는 시퀀싱을 통해 실제로 읽은 대상 영역의 비율을 의미하며 98.3%, 99.4%로 표시됩니다.

일반적으로 검사 결과지의 제공 위치에 따라 앞쪽에 위치할 수도, 뒷쪽에 위치할 수도 있습니다.

방법 (Methods)

이 영역에서는 검사에 사용된 방법론과 장치에 대해 자세히 설명합니다. 검체의 출처와 사용된 시퀀싱 장치, 변이 우선순위 지정 및 해석 방법 등이 포함됩니다.

제한 사항 (Limitations)

이 영역에는 검사의 기술적 한계가 적혀 있습니다. 사용된 키트에 따라 엑솜 검사에 일반적으로 전체 엑손 영역을 읽을 수 없다는 한계가 있으며, 변이의 위치 및 유형에 따라 변이 검출이 불가능할 수 있습니다.

위에서 설명한 바와 같이, 병원에서 사용하는 유전자 검사 서비스를 제공하는 대부분의 실험실은 ACMG(미국임상유전학회) 가이드라인을 따르기 때문에 대부분의 검사 결과지를 비슷한 양식을 따릅니다.

유전자 검사에 대한 접근성이 높아지고 여러 유전자 검사 서비스 제공업체가 결과지를 보다 쉽게 해석할 수 있도록 개선하고 있는 만큼, 더 많은 희귀질환 환자들의 진단 방랑이 끝날 수 있기를 바라봅니다.